消费者在购买商品后，如果商家主动联络消费者，告知无法在规定时间内完成发货，平台也会将该订单判定为缺货订单。因此，如果商家确认无法发货，建议采取以下措施：

拼多多缺货申请影响店铺信誉，罚款金额是多少

1. 立即下架无货商品：及时下架那些缺货的商品或SKU，以防止产生更多无法发货的订单，造成更大的损失。

2. 对确认已经发不出货的订单，先安抚好消费者，同时主动向拼多多平台申请缺货处理，维护好和买家的关系，这样做才能可持续性发展。

3. 合理设置库存：在后续的经营过程中，商家应根据商品的实际库存、自身的生产能力和发货能力等因素，设置合理的库存水平，避免因库存不足而导致的缺货问题。

4. 妥善处理消费者关系：对于确认无法发货的订单，建议商家主动与消费者保持沟通，安抚他们并积极向拼多多平台申请缺货处理，这样才能维护良好的客户关系，实现可持续发展。

值得注意的是，赔偿标准如果出现小数部分时，会取整数部分。例如，若某个订单的实际金额为470元，则其赔偿金额应为470元的5%，即23.5元，最终赔偿为23元。

总的拼多多店铺在申请缺货时，确实会受到一定的影响。缺货订单不仅可能会导致平台的处罚，还可能影响商家的信誉和客户关系。因此，商家需在日常运营中保持充足的库存供应，若发现库存不足，应及时下架产品，避免缺货情况的发生。